中亚地区的气候变化、水资源减少、生物多样性丧失以及跨界环境威胁，都要求该地区各国加强合作。在此背景下，乌兹别克斯坦和吉尔吉斯斯坦在生态和环境保护领域的合作近年来稳步拓展，达到了一个新的高度。
两国环境合作的法律基础是1996年12月24日签署的《关于环境保护和合理利用自然资源的政府间合作协定》。该协定建立了相关部委和机构间的定期对话机制。两国专家积极参与环境论坛、国际会议、科学研讨会和培训课程，就紧迫的环境问题交流专业知识。
值得注意的是，2022年至2025年间，两国互动显著加强。2022年，乌兹别克斯坦代表参加了在比什凯克举行的第七届全球雪豹和生态系统保护计划（GSLEP）指导委员会会议。2023年，两国举办了打击非法野生动物贸易区域研讨会，为提升两国专家的技能提供了重要平台。2024年，两国还举办了根据《联合国气候变化框架公约》编写两年期透明度报告的培训研讨会。
2024年7月19日，与吉尔吉斯共和国自然资源、生态和技术监督部签署了一份关于在绿色大学分配奖学金名额的备忘录。该文件有助于建立一种培养环境领域现代人才的新模式。此外，2024年12月，绿色大学与吉尔吉斯共和国大使馆共同举办了国际山岳日纪念活动，这成为加强环境外交和科学合作的重要一步。
环境问题超越国界。正因如此，两国共同参与了多项国际和区域倡议。2019年，哈萨克斯坦、吉尔吉斯斯坦和乌兹别克斯坦签署了《关于管理西天山跨界联合国教科文组织世界遗产地的谅解备忘录》。该文件已成为保护独特山地生态系统的重要机制。2021年，三国又签署了《关于保护西天山和帕米尔-阿莱地区雪豹、其猎物及其栖息地的谅解备忘录》。
此外，两国在独联体、上海合作组织、拯救咸海国际基金、全球可持续土地利用规划（GSLEP）及其他国际平台上积极开展合作。2023年，中亚国家在联合国气候变化大会（COP28）上共同起草了一份联合气候声明。2024年，该地区各国环境部长出席了“绿色大学”的开幕式。2025年，乌兹别克斯坦代表团积极参加了在乔尔蓬阿塔举行的全球可持续土地利用规划指导委员会第九次会议。
乌兹别克斯坦和吉尔吉斯斯坦还与多个主要国际组织开展联合项目。这些项目包括与国际动植物保护组织（FFI）合作打击非法野生动植物贸易、与德国国际合作机构（GIZ）合作开展“绿色中亚”项目、气候风险管理和综合土地管理，以及与国际自然保护联盟（IUCN）合作开展增强景观抵御人畜共患病能力的倡议。这些项目有助于改善该地区的环境治理，加强科学能力建设，并引进现代环境技术。
如今，两国面临新的挑战。首先，让吉尔吉斯斯坦加入乌兹别克斯坦-哈萨克斯坦锡尔河流域水质和环境保护联合工作组，将有助于有效管理跨境水资源。
其次，加强对天山西部特别保护自然区域联合管理的对话，将有助于保护生物多样性，保护野生动物迁徙路线，并扩大科学信息的交流。
第三，在联合国欧洲经济委员会的支持下，推动中亚国家开展“区域环境绩效评估”倡议，将有助于建立统一的区域机制，以评估环境政策的有效性。扩大在生态学、水资源、冰川监测、高山积雪和生物多样性等领域的联合科学研究仍然是一项紧迫的任务。跨境环境安全问题尤其受到关注。
乌兹别克斯坦和吉尔吉斯斯坦之间的环境合作目前正迈向战略伙伴关系的高度。在气候变化、水安全、生物多样性保护、绿色经济发展和科学创新等领域的联合行动，不仅对两国至关重要，而且对确保整个中亚地区的环境可持续性也至关重要。毫无疑问，进一步深化科学合作、加强跨境环境监测、拓展国际项目以及发展环境外交，将把乌兹别克斯坦共和国和吉尔吉斯共和国之间的战略伙伴关系提升到一个全新的可持续发展水平。
